华南农业大学经济管理学院由国立中山大学农学院与私立岭南大学农学院的农业经济教育专业发展而来。1952年院系调整后，华南农业大学农学系停止招收农业经济专业的学生。之后，在农业经济教研室全体老师的努力和积极要求下，农业经济专业于1964年恢复招生。文化大革命期间，农业经济专业停止招生，直至1979年再次恢复招生。1982年成立农业经济系，1992年经农业部批准成立经济贸易学院。2004年5月更名为经济管理学院。
学院以“致知、明德、经世、济国”为院训，以培养人才服务社会为宗旨，已形成了以农业经济管理国家重点学科和广东省重点学科为依托的复合型学科群，以国务院学科评议组召集人、教育部长江学者特聘教授、广东省珠江学者特聘教授为学科带头人的人才梯队，以教育部长江学者“创新团队”为核心的科研团队，以广东农村经济研究中心和广东农业企业发展研究中心两个广东省人文社科重点研究基地为支撑的科研平台，是一所融农业经济、林业经济、产业经济、劳动经济、企业管理、金融、贸易、财会诸学科为一体，具有博士后、博士、硕士、本科等多层次人才培养体系，在人才培养、科学研究、社会服务和文化传承等方面取得了可喜成就，在国内外具有重要影响力的学院。
现有农林经济管理一级学科博士学位授权点1个，含农业经济管理、林业经济管理、农村与区域发展、农村组织与制度、食物经济与管理等5个二级学科博士点；有农林经济管理、应用经济学2个一级学科硕士学位授权点，有农业经济管理、林业经济管理、土地资源管理\区域经济学、金融学、产业经济学、国际贸易学、劳动经济学和企业管理9个科学学位硕士点，1个农村与区域发展专业硕士学位点。
现有农业与资源经济系、会计系、金融系、经济贸易系、工商管理系、市场营销与物流系等6个教学系，开设农林经济管理、会计学、工商管理、人力资源管理、市场营销、物流管理、电子商务、经济学、国际经济与贸易、金融学等10个本科专业。
现有农林经济管理博士后科研流动站1个；有广东农村经济研究中心和广东农业企业发展研究中心2个广东省人文社会科学重点研究基地；有华南农业大学经济发展研究所、华南农业大学林业经济研究中心、华南农业大学土地经济与管理研究中心、华南农业大学人力资源与发展战略研究中心等4个校级研究机构。